Пятый сезон в премьер-лиге сложился для томичей с игровой точки зрения более ровно, нежели предыдущие, когда команду бросало в крайности и она могла в течение одного сезона побывать и среди лидеров, и на дне турнирной таблицы. Несмотря на отдельные взлеты и падения, «Томь» весь сезон провела в районе 10–12-го места, что с учетом ее финансовых возможностей было несомненным успехом. Многоопытному главному тренеру Валерию Непомнящему удалось привнести самое важное — стабильность.
В межсезонье бело-зеленым пришлось серьезно перекраивать состав, что является уделом всех клубов с бюджетом «ниже среднего». Томск покинули вчерашние игроки основного состава — Мандрыкин, Вейич, Тарасов, Стойка, Ширко… На их место пришла целая группа новичков, из которых по большому счету заиграли только Дмитрий Н. Смирнов да арендованный у московского «Спартака» защитник Андрей Иванов. А вот Филипенко, Поляков, Немет, Дядюн, Ковальчук лишь увеличили скамейку, но никак не конкуренцию. В плане селекции «Томь» куда успешнее была летом, несмотря на то что именно в этот период клуб испытывал наиболее сильное влияние финансового кризиса. Взятые в аренду Дмитрий А. Смирнов и Дзюба пригодились Валерию Непомнящему на финише сезона.
Томичи по ходу сезона запомнились несколькими яркими матчами. Им удалось, в частности, победить ЦСКА и «Динамо» в Москве, «Зенит» в Петербурге. За неимением звезд брала «Томь», как и полагается, командной игрой. При этом значительно лучше, чем в прежние годы, сыграли полузащитники Радосавлевич и Харитонов и нападающий Корниленко, чья результативность в первом круге чемпионата удивила всех.
Хитом сезона стало, разумеется, обращение руководства томского клуба за помощью к правительству страны. Эту тему обсуждали все и вся, отзываясь в основном о шаге со стороны «Томи» в негативных тонах. Как бы то ни было, сей ход, возможно, позволил томичам избежать краха и сохранил команду для премьер-лиги. Теперь в Томске мечтают о еврокубках.